بالرغم من الفوائد العديدة للأعشاب الطبيعية للجسم، إلا أنه تجدر الإشارة إلى أن هذه الأعشاب ليست امنة تمامًا وقد تنجم عنها بعض الاثار الجانبية التي تتنوع تبعًا لنوع العشبة وقد تختلف في شدتها، ولكنها قد تشمل الاتي بشكل عام:
1-الحساسية.
2-الطفح الجلدي.
3-نوبة ربو.
4-الصداع.
5-الغثيان.
6-القيء.
7-الإسهال.
بالإضافة إلى أن الأعشاب يمكن أن تتفاعل مع الأدوية الأخرى، وقد لا يكون بعضها ملائمًا للاستخدام من قبل الحامل أو المرضع، لذا يجب دائمًا استشارة الطبيب قبل البدء في تناول الأعشاب الطبيعية.